『壹』 如何用python将fastq转化为fasta
/* * fq2fa.cpp * convert fastq to fasta *#include <iostream>#include <fstream>#include <cstring>#include <cstdlib>using namespace std;long line = 0; int main(int argc,char *argv[]) { ifstream fin; ofstream fout; if(argc != 3) { cout << "ERROR: illegal argument number: " << argc << endl; cout << "Uasage: \n \t fq2fa fastaq_file fasta_file \n" <<endl; exit(0); } fin.open(argv[1]); fout.open(argv[2]); if(!fin.good()) { cout << "ERROR: illegal input file path: " << argv[1] <<endl; cout << "Uasage: \n \t fq2fa fastaq_file fasta_file \n" <<endl; exit(0); } else if(!fout.good()) { cout << "ERROR: illegal output file path" << endl; cout << "Uasage: \n \t fq2fa fastaq_file fasta_file \n" <<endl; exit(0); } cout << "Converting Data…" << endl; int mod; line=0; while(fin != NULL) { string s; getline(fin,s,'\n'); if (s==""){ continue; } line=line+1; mod=line % 4; if (mod == 1){ s[0]='>'; fout << s << endl; } if (mod == 2){ fout << s << endl; } } cout << "finished!" << endl; fout.close(); fin.close(); return 0; }g++ -o fq2fa fq2fa.cpp 编译即可
『贰』 如何将fastq格式转化为fasta格式
Windows自带的画图软件就可以打开TIF格式的文件。你先用画图打开这个文件，然后在菜单“文件”里用“另存为”命令，把保存类型选择为需要的格式即可。画图在开始菜单–所有程序–附件里。
『叁』 怎样把.txt格式修改成.fasta格式
XP系统：如果你的文件名是“ABC”，你就把ABC.txt改成ABC.fasta即可。vista系统：点击文件夹和系统搜索选项，选查看选项卡，高级设置里在 隐藏文件夹 隐藏扩展名前面去掉勾，再重复上面步骤。
『肆』 fasta格式转换
把每个fasta的序列都拷贝到同一个文件里面每一个序列的前面加">序列的名字，回车"举例：序列一：ATCGATCG序列二：AAAAA序列三：CCCCC合并以后的>no 1ATCGATCG>no 2AAAAA>no 3CCCCC
『伍』 怎么把自测序列转换成fasta格式的啊
你试试DnsP软件，将你的序列复制到txt文本，然后直接改文件名为fas，
『陆』 怎么把miseq数据的fq格式转化为fasta格式 mothur
您好，请问您是想知道怎么把miseq数据的fq格式转化为fasta格式 mothur吗？
『柒』 fastq怎么转fasta linux 命令
在linux下运行下面的命令，编译一下就可以使用了g++ fq2fa.cpp -o fq2fafq2fa.cpp的源代码如下：/*将fastaq 转换成 fasta 文件*/#include <iostream>#include <fstream>#include <cstring>#include <cstdlib>using namespace std;long line = 0;int main(int argc,char *argv[]){//对命令行下输入参数进行处理 ifstream fin; ofstream fout; if(argc != 3)//三个参数，这个值是3，还有一个是程序名称 { cout << "ERROR: illegal argument number: " << argc << endl; cout << "Uasage: \n \t fq2fa fastaq_file fasta_file \n" <<endl; exit(0); } fin.open(argv[1]);//参数从1开始，0是名称 fout.open(argv[2]); if(!fin.good()) { cout << "ERROR: illegal input file path: " << argv[1] <<endl; cout << "Uasage: \n \t fq2fa fastaq_file fasta_file \n" <<endl; exit(0); } else if(!fout.good()) { cout << "ERROR: illegal output file path" << endl; cout << "Uasage: \n \t fq2fa fastaq_file fasta_file \n" <<endl; exit(0); } cout << "Converting Data…" << endl; /*ofstream fout("out.txt"); ifstream fin("sample.txt");*/ int mod; line=0; while(fin != NULL) { string s; getline(fin,s,'\n');if (s==""){continue;} line=line+1; mod=line % 4; if (mod == 1) {s[0]='>';fout << s << endl; } if (mod == 2) {fout << s << endl; } }cout << "finished!" << endl; fout.close();fin.close(); return 0;}
『捌』 如何用Perl脚本将gff格式转换为fasta格式
如果目的是学习perl，对于没学习两种文件格式的人来讲一时半会看不懂两者之间的关系，以及如何变幻的，所以难以回答最好碰到一个精通perl同时又是你这专业的人 才行
『玖』 如何将out文件转换成fasta格式
如何下载土豆网和youtube、56网、KU6网等的视频 目前土豆网或者youtube的视频只能在线观看，不能直接下载，但其实在你在线观看后，已经下载在《临时文件夹》中了。 保存已观看的视频方法： 1.在IE浏览器的”工具”中选择”internet选项” 2.在”internet临时文件夹”位置点击”设置”，在新窗口中点击”查看文件” 3.在这个新打开的”TemporaryInternetFiles”窗口中，就可以看到很多文件了。 4.按照文件大小排序，文件格式后缀为flv的文件就是在土豆网或者youtube上在线看完后自动保存下来的文件，这时你只需把该文件复制出来，粘贴到某个地方，再把名字一改~~ 搞定~ 5.最后，这种后缀为flv的文件可以用”暴风影音”播放~~ 6.有需要别的格式的兄弟，可以下载 千千静听–安装后–把刚才复制出来的“这种后缀为flv的文件”拉进去—然后点击它右键–〈转换格式〉—- 第一行的 《编码格式》 可以修改成 mp3 或者 wma, 然后在 选项—目标文件夹–选好你要保存的路径—最下边–立即转换~~
『拾』 如何将fastq文件转化为fasta文件
Windows自带的画图软件就可以打开TIF格式的文件。你先用画图打开这个文件，然后在菜单“文件”里用“另存为”命令，把保存类型选择为需要的格式即可。画图在开始菜单–所有程序–附件里。
