⑴ 如何用LAMMPS算石墨烯的声子谱
在LAMMPS编译过程中，需要将URER-PHONON包编译进去。第一步：获得体系的动力学矩阵输入文件：in.graphene — 结构和参数控制；SiC.tersoff — C 的势函数map.in — 告诉程序不同晶格位置对应的原子ID
in.graphene：
具体请参看http://wenku..com/link?url=-5sExat1NE6gHngvUecpqzeqC_-uT5S
⑵ lammps分子动力学模拟菜鸟入门求助
其实我在别的地方已经写过这些了，再次摘抄过来。个人感觉Lammps入门不那么简单，最好能有学长带你。还是首先看你题目做那个方向，做传热相关还是力学相关? 那种材料？我只知道一点做晶体声子传热仿真的，要看些固态物理，晶格动力学和统计力学的书籍或相关材料。或者有师兄师姐带的话可以直接上手先做起来，叫他们给个例子，自己先跑通，然后学习例子里面包含的知识点。同时可以看看你要做的项目别人发过的文章，用到什么理论知识，然后自己去找相关资料。说的比较笼统。反正建议先着手做结果，再慢慢完善理论，不要先找全了书一页页看，往往很多东西用不上，时间长了自己也没信心。另外做力学的话，现在很火的是做位错（dislocation），还有边界（grain boundary）抵挡断裂或者变形的影响，这块我不清楚，不过建议还是多看看别人文章。软件要从官网下最新的版本，然后要自己编译。下面是我回答别人类似的一个问题，我再摘抄过来。材料的势能场参数很关键，要确保能有好的势能参数，输到Lammps里头才能跑出好结果。然后要先从例子开始。如果你有师兄师姐以前做过，那就好办了，先拿人家的input file（也就是给Lammps输入的命令序列）过来看，里面会已经有个能跑得框架就好，之后一些常用命令，比如怎么设置仿真盒子大小，读入原子坐标，设置压强温度控制，跑多少步什么的，直接抄过来（最好到网站上搜这些命令的用法，然后自己对照着自己想法改，或者有书也不错，查查用法。）命令的话不要去背，太多了。至于建模比较麻烦，因为这款软件不像有限元集成了建模功能，你得自己编程，matlab，fortran，c语言都可以，想办法把你要仿真的一堆原子坐标都算出来，然后打出到纯文本文件（里面记录每个原子的序号，类别，坐标和速度），再和你的input file放到一起给Lammps算。之后跑完Lammps给的结果还需要些后处理，有可能还要编点小程序来处理。另外你是要用自己电脑跑吗？还是有学校超级计算机让你用。反正最好是能先跑起来，哪怕把人家例子（或者网站上的例子）跑会了就成功一大半了。光看书资料自己没感觉的。我看没人回答就随便写上几句，希望你能成功。
⑶ 用lammps做分子动力学新手求助
您好，在贴吧看到您的问题，我来回答你：在windows下也可以运行，不过好像不能做并行计算了，在windows下用DOS就可以用了，在LAMMPS Windows serial executable ,会得到一个lmp_win_no-mpi.exe,我将它放在e:\lammps下。将一个实验用的in.colloid输入文件也放在lammps下，用以测试。开始-运行-cmd,找到可执行文件的位置，输入“e:”回车，输入“cd lammps”,然后按照手册上的说明输入“lmp_win_no-mpi -in in.colloid”就开始算了！（mpi后面有个空格！）如你还有别的问题，可另外向我求助；答题不易，互相理解，互相帮助。
⑷ 斜方晶系在lammps输入文件中怎么输入
斜方肌分为上中下三束，上束可以用站姿哑铃耸肩，中，下束可以用俯身肩胛骨后缩，做的时候注意头不要过度前伸
⑸ 怎样读入lammps in文件
首先，你要认真阅读manual的read_data命令，这个命令用来读取data文件，data文件的格式manual里面有详细介绍。改变运行次数，用run命令，后面接要运行的次数，如run 1000000先安装vmd，打开vmd，选择file-new molecule,然后选择你的lammps输出文件。一般输出XX.lammpstrj格式和.xyz格式，如果这也不清楚的话，你看manual里面关于mp，thermo的介绍。总之关于lammps有问题最好的解决办法就是RTFM，Read The Fucking Manual!
⑹ lammps输出文件在哪里
lammps输出文件输出后会输出到系统运行框中，在运行栏中输入cmd即可打开系统运行框，看到我们的输出文件。mp是LAMMPS最常用的输出命令。LAMMPS中处理的输出数据主要分以下三个大的部分：1.断点数据，这个主要是为了防止模拟过程中出现意外，比如实验室或机房突然断电，程序部分阶段有错误等等。2.系统热力学量的输出，这些量一般是体系中各个原子的集体行为量，比如温度，压强等3.单原子详细信息的输出，如我们想得到的轨迹文件
⑺ lammps该怎么入门
这个…感觉Lammps入门还是要有段时间的，不过我个人不是很擅长学新的东西。命令的话不要去背，太多了。首先看你题目做那个方向，做传热相关还是力学相关? 那种材料？材料的势能场参数很关键，要确保能有好的势能参数，输到Lammps里头才能跑出好结果。然后要先从例子开始。如果你有师兄师姐以前做过，那就好办了，先拿人家的input file（也就是给Lammps输入的命令序列）过来看，里面会已经有个能跑得框架就好，之后一些常用命令，比如怎么设置仿真盒子大小，读入原子坐标，设置压强温度控制，跑多少步什么的，直接抄过来（最好到网站上搜这些命令的用法，然后自己对照着自己想法改，或者有书也不错，查查用法。）至于建模比较麻烦，因为这款软件不像有限元集成了建模功能，你得自己编程，matlab，fortran，c语言都可以，想办法把你要仿真的一堆原子坐标都算出来，然后打出到纯文本文件（里面记录每个原子的序号，类别，坐标和速度），再和你的input file放到一起给Lammps算。之后跑完Lammps给的结果还需要些后处理，有可能还要编点小程序来处理。另外你是要用自己电脑跑吗？还是有学校超级计算机让你用。反正最好是能先跑起来，哪怕把人家例子（或者网站上的例子）跑会了就成功一大半了。光看书资料自己没感觉的。我看没人回答就随便写上几句，希望你能成功。
⑻ lammps怎么查找c-h-n-o势函数
在LAMMPS编译过程中，需要将URER-PHONON包编译进去。第一步：获得体系的动力学矩阵输入文件：in.graphene — 结构和参数控制；SiC.tersoff — C 的势函数map.in — 告诉程序不同晶格位置对应的原子IDin.graphene：具体请参看http://wenku..com/link?url=-5sExat1NE6gHngvUecpqzeqC_-uT5S
