castep文件夹|如何通过pbs提交materials studio计算任务

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Ⅰ 我另存的 选的是 INI 格式 ,怎么保存之后变 DAT 格式了

第一,在安装之前一定的把你原来的全部删除掉,有些需要手动删除,卸载不掉的。? 第二,安装过程一定不要出现汉字(安装盗版的经验)。 1. 在安装之前,最好将所有杀毒软件的防火墙以及系统的防火墙全部关闭,神马360,QQ管家,金山都关闭; 2. 进入MS5.5安装文件夹,点击安装Autorun.exe,选择install Material Studio,在安装过程中,若软件会提示是否安装GATEWAY,允许安装,安装结束会出现安装license页面,关闭即可,下一步在安装(安装在C盘);? 3. 打开文件夹“license?pack?”,双击“lp-setup.exe”安装license?server.? 4. 把ms.lic拷贝到 C:\Program files\Accelrys\LicensePack\Licenses文件夹下(目前应该是空的) 5. 双击ms.lic,如果打不开的话,选择用“记事本”打开。将msi.lic文件中的SERVER?this_host?ANY?1715的this_host?改为计算机名(查看自己计算机名可以右击“我的电脑”选“属性/计算机名”),将DAEMON?msi后面加上路径名(默认安装时,一般是C:\Program?Files\Accelrys\License?Pack\Licenses,一般不用修改),然后保存; 6. 选择开始-程序-accelry\licensing\license?administrator7.6.5,?点击License File\Install?License,右侧会出现install license的页面,点击Browse,选择C:\Program?files\Accelrys\LicensePack\Licenses\ms.lic(即第4步下的文件路径),点击install安装.?过会就会显示安装成功了。 7. 在license?administration画面,点击license?server?下的connection,单击画面底部的Edit,Hostname里填上我的电脑名,点击ok即可.其它不变。 8. 然后运行License??Test测试一下,就会发现通过了。显示如下: Attempting checkout… Checked out license feature: License_Holder <v7.6> [for msi] (1 ) Checkout succeeded.. 可以看看 Configuration Summary: License File Installed: Yes Temporary License File Installed: No Server Connections: 1715@0AE0A1842792475(你的电脑名字). Server License Pack Version: Unavailable Server Status: 1715@0AE0A1842792475. Stopped 有些显示为no,不用管它,不影响计算就行了。9. 启动MS,首先需要新建计算文件夹,记住一定不能是中文命名的,像我的文档是不行的。可以在D盘下新建一个MS文件,以后计算文件放着里面就可以。10. 运行后发现正常,可以Castep来计算,并有正常结果输出,安装成功。

Ⅱ 如何通过pbs提交materials studio计算任务

如何使用命令行方式提交 MS 的计算作业 Castep: 1. 打开 MS 界面, 建立相关模型, 并且在 Castep 的 Calculatiton 对话框中设置相关参数; 2. 不要单击 Run 进行 Castep 计算工作,而要在 Calculation 对话框中选择 Files -> Save Files,此时会在 Project Explorer 中出现一个新的目录,其中包括了使用命令行运行 Castep 的输入文件; 3. 使用 Windows 的文件管理器进入该目录(相关 Project 名称.files\Documents 下), 能够 看到所需要的输入文件。 注意,由于 castep 计算所需的.cell 文件是隐藏文件,因此需要在“工具|文件夹选项” 中选择“显示隐藏文件” 。 将以下文件拷贝到 SGI Prism 的相关路径下, *.cell、*.param。 此外,需要将计算所需的赝势文件拷贝到 SGI Prism 相关路径下。 (在 CASTEP | Calculation | Electronic 的 more 下 Potential 中可以看到所使用的赝 势 文 件 , 该 文 件 的 路 径 在 Windows 系 统 的 <MS 安 装 路 径 >\MS Modeling 3.2\Data\Resources\Quantum\Castep\Potentials 中,请将所出现的赝势文件全部拷贝到 SGI Prism 机器上,否则会导致计算失败) 4. 使用帐号登陆到 SGI Prism 下,进入相关文件夹(文件夹中包括刚才所有的文件) , 并执行命令: > chmod 777 *.* > /home/msi/ms/CASTEP/bin/RunCASTEP.sh -np n seedname 注:-np 表示使用多 CPU 进行并行运算; n 表示所使用的 CPU 数目 seedname 表示计算作业的名称, 例如相关参数文件为 Al.param, Seedname 则 为 Al,不带后缀名 5. 计算完成后,请将该目录中所有的文件下载到本地机器上,并放到刚才在 Visualizer 下新建的目录中; 6. 在 Visualizer 的 Project Explorer 中单击右键,选择刷新,即可看到刚才所有计算得 到的结果,并可在 MS 中进行分析。 DMol3 1. 打开 MS 界面, 建立相关模型, 并且在 DMol 的 Calculatiton 对话框中设置相关参数; # 2. 不要单击 Run 进行 DMol 计算工作,而要在 Calculation 对话框中选择 Files -> Save Files,此时会在 Project Explorer 中出现一个新的目录,其中包括了使用命令行运行 DMol3 的输入文件; 3. 使用 Windows 的文件管理器进入该目录(相关 Project 名称.files\Documents 下), 能够 看到所需要的输入文件。 注意,由于 DMol3 计算所需的.car 和.mdf 文件是隐藏文件,因此需要在“工具|文件 夹选项”中选择“显示隐藏文件” 。


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